办公室：
　　协助局领导处理日常工作，适时提出重要工作建议，协调机关各科室工作；参与本局综合性文件和重要政策法规的调查研究和起草实施协调工作，审核局机关发出的公文，搞好文印管理，检查督促卫生行政执法工作；拟定年度工作计划、总结，督促检查工作计划的执行情况；组织制定机关规章制度，检查落实情况；负责局务会议及其他有关会议的组织、准备工作，督促检查会议决议落实情况，及时办理人大、政协交办的提案、议案，向领导提供有价值的信息，为领导决策服务；负责机关对外接待工作和承办其它事宜；搞好机关行政事务管理，保证局领导及业务用车，搞好水、电、暖供应；主持办公室文秘、保卫、保密、档案、计划财务、报帐、资产管理、卫生统计、信息化建设、信访等各类日常工作，搞好机关安全防范和来信来访接待工作；组织机关全体人员政治学习，做好政治思想工作；编制全市基层医疗单位基本建设、装备计划并协调实施；管理好全市医疗卫生机构服务工作；按要求完成领导交办的工作。

人事科：
　　根据局工作要点和干部、人事、党建、精神文明建设工作要求，制定本科工作计划，经领导同意后组织实施；根据党和国家有关方针、政策和局工委决定，对局机关、局属单位的局管干部、职工的录用、调配、晋升、任免、奖惩、考核、工资、福利、保险、离退、教育培训、职称评审、干部审查等工作，作出具体安排并组织实施；根据局工委的意见，组织对局管各级领导班子的考察工作，提出调整配备的建议方案，报局工委决策；组织调查研究，提出全局系统干部队伍建设（后备干部队伍建设）规划，经局工委同意后组织实施；根据局机关各时期党的组织、宣传工作任务，有针对性的提出各项计划和措施，协助局领导抓好机关党的建设，做好职工的思想政治工作；负责组织实施领导交办的其它工作。

社会卫生科（爱卫办）：
　　组织拟定爱国卫生、农村卫生、社区卫生服务、妇幼卫生的长远规划和实施计划，报局领导审批后组织实施；负责组织开展全市爱国卫生活动及检查、评比、表彰、命名等工作；负责对上级下达的有关农村卫生、社区卫生服务、妇幼卫生等指令性任务，进行组织协调、检查、落实等工作；负责督办妇幼保健及外资项目，农村基础设施建设项目的开展；完成领导交办的其他工作。

医政科：
　　根据全局年度工作计划及重点，组织制定本科工作计划，并负责实施；根据国家和省有关法规要求，组织调研和起草全市的医疗机构发展规划、卫生资源配置规划及医药管理、医疗保健等工作计划，并组织实施；作好全市医疗机构大型医用设备的审核实施；实施医疗机构的医疗质量和服务质量的监督管理工作；监督管理医疗机构和卫生技术人员执业许可制度；对血站的采供血及临床用血质量做好监督管理；完成领导交办的工作。

疾病控制与执法监督科：
　　根据省卫生厅的工作部署，结合我市实际情况，组织拟定疾病控制、食品卫生、计划免疫、职业病防治的长远规划和实施计划，报局领导审批后组织实施；负责组织开展全市食品卫生、计划免疫活动及检查、评比、表彰、命名等工作；根据《食品卫生法》等法律法规，负责督办疾病控制、监督行政执法工作，组织处理卫生监督方面行政复议案件及诉讼工作；负责对上级下达的有关卫生防病等指令性任务进行组织协调、检查、落实等工作；完成领导交办的工作。

地方病防治领导小组办公室：
　　宣传贯彻有关地方病防治法律、法规、规章和政策，宣传、普及地方病防治科学知识；拟订全市地方病防治规划，制定年度防治计划；组织调查病（疫）情，并根据病（疫）情资料，提出防治措施和防治方案，协调有关部门组织实施；组织监测病（疫）情，对防治措施及防治效果进行监督检查、评估、指导。

献血办公室：
　　贯彻执行国家有关血液管理的政策规定，制定全市献血、输血规划和工作计划，拟定血液管理工作实施细则；负责全市公民献血的宣传、动员和组织实施；负责全市及跨市用血的调配管理工作；负责全市医疗机构临床用血管理和登记报批工作；负责全市采供血服务机构管理及供血证的发放管理；建立供血者档案，并负责管理和核查；负责全市采供血统计工作；负责全市红十字会工作。

监察室：
　　检查机关国家公务员和局属单位在遵守和执行法律、法规和市委、市政府决定，命令中的问题并做出相应监察处理；对违反廉政法律、法规而出现的各种不廉洁的问题进行廉政监察；，对违反勤政高效法律、法规的失职渎职、管理混乱、效能低下的问题进行效能监察；调查公民、基层单位和其他组织对市卫生局机关、局属公务员和市政府有关行政机关任命的其他人员违反行政纪律行为的检举和控告；受理国家公务员和市政府各类行政机关任命的其他人员不服主管行政机关给予行政处分决定的申诉，以及法律、法规规定的由监察机关受理的申诉；履行好法律、法规规定由监察机关履行的其他职责。